中大新聞網(wǎng)訊（康峻鳴）附屬第一醫(yī)院呂萬革教授團隊聯(lián)合張弩教授團隊系統(tǒng)性繪制膠質(zhì)瘤功能性增強子互作圖譜，解析風險SNP驅(qū)動的促腫瘤機制，相關(guān)研究成果發(fā)表于《Nature Cell Biology》（自然-細胞生物學）。
神經(jīng)膠質(zhì)瘤（Glioma）是侵襲性強的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤，五年生存率不足10%。盡管全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）已發(fā)現(xiàn)多個與風險相關(guān)的非編碼區(qū)域的單核苷酸多態(tài)性（SNP），其致病機理仍不清楚。
該研究通過結(jié)合高通量CRISPRi與H3K27ac HiChIP技術(shù)，系統(tǒng)繪制膠質(zhì)瘤增強子互作網(wǎng)絡(luò)，精準配對促腫瘤增強子與遠端靶基因。團隊發(fā)現(xiàn)多數(shù)已報道風險SNP位于增強子。以rs2297440為例，該位點所在增強子雖位于RTEL1內(nèi)含子區(qū)域，卻通過三維染色質(zhì)與SOX18相互作用驅(qū)動其表達；敲除增強子或?qū)L險等位基因單堿基編輯為非風險形式，均降低增強子互作與腫瘤細胞增殖。機制上，轉(zhuǎn)錄因子MEIS1偏好結(jié)合風險等位基因并上調(diào)SOX18，形成“rs2297440–MEIS1–SOX18”促腫瘤機制。
本研究提供了膠質(zhì)瘤增強子連接組資源，闡明非編碼變異如何重塑遠程調(diào)控并推動腫瘤進展，為精準治療提供潛在靶點。
附屬第一醫(yī)院呂萬革教授、張弩教授和蘇光松副教授為該論文的通訊作者，附屬第一醫(yī)院博士后畢進方、莫偉鵬、南開大學已畢業(yè)博士生劉滿為該論文共同第一作者。
